[發明專利]一種基于DNA條形碼鑒定落羽杉屬種質資源無性系的方法在審
| 申請號: | 202010902953.2 | 申請日: | 2020-08-31 |
| 公開(公告)號: | CN112029888A | 公開(公告)日: | 2020-12-04 |
| 發明(設計)人: | 楊穎;段豪;王紫陽;於朝廣;劉向東;宣磊;殷云龍 | 申請(專利權)人: | 江蘇省中國科學院植物研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京申云知識產權代理事務所(普通合伙) 32274 | 代理人: | 邱興天 |
| 地址: | 210014 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 dna 條形碼 鑒定 落羽杉 種質 資源 無性 方法 | ||
1.一種基于DNA條形碼鑒定落羽杉屬種質資源無性系的方法,其特征在于,步驟包括:
1)提取待測樣品的葉綠體DNA;
2)利用DNA條形碼引物對PCR擴增所提取的待測樣品的葉綠體DNA,所述的DNA條形碼引物對如下所示:
上游引物:5′-TCACAGCCCAGGCACAA-3′
下游引物:5′-GGTGCGGCTGGATTACCT-3′
3)對PCR擴增產物進行測序;
4)以步驟3)獲得的測序結果與35條落羽杉屬種質資源無性系的DNA條形碼構建系統進化樹,序列與35個種質資源無性系中的一種聚在一起,且與該種堿基序列100%匹配,則待測樣品屬于該落羽杉屬種質資源的無性系。
2.根據權利要求1所述的基于DNA條形碼鑒定落羽杉屬種質資源無性系的方法,其特征在于,步驟4)中,所述的35條落羽杉屬種質資源無性系的DNA條形碼,如下所示:
落羽杉L2的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.3所示;
落羽杉L7的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.4所示;
落羽杉L8的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.5所示;
落羽杉LP2的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.6所示;
落羽杉L12的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.7所示;
落羽杉L13的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.8所示;
落羽杉L14的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.9所示;
落羽杉L17的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.10所示;
落羽杉CL的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.11所示;
池杉C1的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.12所示;
池杉C5的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.13所示;
池杉C6的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.14所示;
池杉C7的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.15所示;
池杉C8的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.16所示;
池杉C9的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.17所示;
池杉C10的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.18所示;
池杉CT的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.19所示;
池杉ZM8的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.20所示;
池杉ZM10的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.21所示;
墨西哥落羽杉DD的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.22所示;
墨西哥落羽杉A2的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.23所示;
墨西哥落羽杉A3的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.24所示;
墨西哥落羽杉A4的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.25所示;
墨西哥落羽杉XM1的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.26所示;
墨西哥落羽杉XM3的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.27所示;
墨西哥落羽杉XM4的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.28所示;
墨西哥落羽杉XM5的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.29所示;
墨西哥落羽杉XM6的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.30所示;
墨西哥落羽杉XM7的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.31所示;
墨西哥落羽杉XM8的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.32所示;
墨西哥落羽杉JM2的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.33所示;
墨西哥落羽杉JM4的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.34所示;
墨西哥落羽杉JM5的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.35所示;
墨西哥落羽杉B4的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.36所示;
墨西哥落羽杉B6的DNA的條形碼,如SEQ ID NO.37所示。
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