[發(fā)明專利]一種海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010370366.3 | 申請日: | 2020-05-06 |
| 公開(公告)號: | CN111593096A | 公開(公告)日: | 2020-08-28 |
| 發(fā)明(設計)人: | 蔣科技;劉守海;任遠豪;夏利花;李磊;季曉;王亞美;申耀中;李子牛;宋煒;張鳳英;馬凌波;王偉;皮妍;趙明 | 申請(專利權(quán))人: | 中國水產(chǎn)科學研究院東海水產(chǎn)研究所;國家海洋局東海環(huán)境監(jiān)測中心(國家海洋局東海海洋工程勘察設計研究所) |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 上海申浩律師事務所 31280 | 代理人: | 李陽 |
| 地址: | 200090 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 海水 海地 幼體 生物量 檢測 統(tǒng)計 方法 | ||
1.一種海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法,其特征在于,其包括以下步驟:
S1、使用《海洋動物基因組DNA提取試劑盒》提取海地瓜成體DNA,設計海地瓜成體DNA中COⅠ基因的引物,使用COⅠ基因的引物進行PCR擴增,測序得到COⅠ基因序列,將COⅠ基因序列進行Blast比對,鑒定出該COⅠ基因序列為海地瓜的COⅠ基因序列;
其中,COⅠ基因的引物序列為:
上游序列:GACATGGCTTTCCCACGAATG
下游序列:GCTCGTGTGTCTACGTCCA
PCR擴增時,其退火溫度為53℃;
S2、以步驟S1得到的PCR產(chǎn)物為起始標準品,制作4個濃度梯度10-2、10-3、10-4、10-5的標準品;
S3、根據(jù)測序得到的海地瓜COⅠ基因序列,設計熒光定量PCR特異性引物,并驗證引物特異性,驗證通過后,再通過熒光定量PCR絕對定量得到CT值-DNA濃度對數(shù)值的標準曲線及對應的直線方程;
熒光定量PCR特異性引物序列為:
上游序列:GAGGTGTGGGTACAGGATGA
下游序列:CTTAGTAAGAGGAGGAAGGCGG
PCR擴增時,其退火溫度為:60℃;
S4、取不同干重的海地瓜組織并提取DNA,并以不同干重的海地瓜組織所對應的DNA為模板進行熒光定量PCR定量測試,根據(jù)步驟S3的標準曲線得到不同干重的海地瓜組織的DNA所對應的濃度值,進而得到DNA質(zhì)量與海地瓜組織干重的趨勢直線方程;
S5、聯(lián)立步驟S3中的CT值-DNA濃度對數(shù)值的直線方程和步驟S4中的DNA質(zhì)量與海地瓜組織干重的直線方程,以得到海地瓜組織干重與CT值之間的推導關(guān)系式,通過熒光定量PCR測出待測海水樣品中DNA的CT值,并將CT值帶入推導關(guān)系式計算可得到待測海水樣品中海地瓜幼體DNA的濃度值,根據(jù)待測海水樣品中DNA體積,計算得到待測海水樣品中所含海地瓜幼體的DNA質(zhì)量;
S6、通過待測海水樣品中海地瓜幼體的干濕重比例以及推導關(guān)系式計算得到海地瓜幼體的濕重。
2.如權(quán)利要求1所述的海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法,其特征在于,步驟S3中,CT值-DNA濃度對數(shù)值的標準曲線的直線方程為:y=-3.956x+13.139。
3.如權(quán)利要求1所述的海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法,其特征在于,步驟S4中,海地瓜組織的不同干重分別為:10mg、20mg、30mg、40mg、50mg、60mg、90mg、120mg。
4.如權(quán)利要求1所述的海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法,其特征在于,步驟S4中,DNA質(zhì)量與海地瓜組織干重的趨勢直線方程式為:y=0.2266x。
5.如權(quán)利要求1所述的海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法,其特征在于,步驟S5中,海地瓜組織干重與CT值之間的推導關(guān)系式為:N測=n標*10(CT測–13.139)/-3.956*1*V測*10-3/0.2266,n測=n標*10(CT測–13.139)/-3.956*1(N測表示海地瓜測試干重;n標表示標準品濃度;CT測表示測試水樣得到的CT值;V測表示水樣DNA模板體積;n測表示水樣測試得到的目標DNA濃度;n標+測表示標準品與水樣混合后的測試濃度。
6.如權(quán)利要求1所述的海水中海地瓜幼體生物量的檢測統(tǒng)計方法,其特征在于,步驟S6中,干濕重比例為:26.2%。
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