本發(fā)明屬于生物信息領域，具體涉及一種用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng)及其應用。所述的用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng)，包括數(shù)據(jù)輸入模塊、模型計算模塊和結果輸出模塊；該系統(tǒng)以患者的年齡、TNM分期、TM9SF1基因表達值、PDZK1IP1基因表達值作為預測因素。本發(fā)明與TNM分期系統(tǒng)相比，在食管鱗癌病人的預后分期上更為精確，也更為直觀。能夠通過各項危險因素的分數(shù)方便直觀的判斷病人的1年、3年、4年生存率。

技術領域

本發(fā)明屬于生物信息領域，具體涉及一種用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng)及其應用。

背景技術

食管鱗癌(ESCC)是全球第八大最常見的癌癥，ESCC的特點是高侵襲性和預后差。盡管采取了手術、放療、化療等綜合治療，但患者5年生存率仍低于22％。顯著的地理變異提示環(huán)境和遺傳因素在食管鱗癌的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。已知的食管鱗癌的危險因素包括吸煙和飲酒，而水果和蔬菜的攝入在預防食管鱗癌方面具有很高的可能性。目前，TNM分期系統(tǒng)被用來預測ESCC患者的預后，但都沒有提供實質性的預后價值。考慮到ESCC患者在相同的臨床分期時，其臨床病程往往存在顯著差異，因此需要一種新的ESCC分級系統(tǒng)來進行更精確的預后預測，從而實現(xiàn)一種更有針對性的治療方法，改善該疾病的預后。同時，ESCC仍缺乏有效的靶向治療，因此鑒定ESCC特異的基因標志物，將為開發(fā)ESCC分子靶向治療奠定理論基礎。

目前腫瘤預后的金標準仍然是TNM(腫瘤淋巴結轉移)分期系統(tǒng)。最初在1953年由法國外科醫(yī)生皮埃爾Denoix作為實體瘤預后的共同語言提出。然而，TNM分期有幾個缺點。首先，它受到疾病解剖學進展與分期進展之間的相關性的限制。因此，具有相同解剖擴散但結果不同(復發(fā)或存活)的患者被迫進入同一分期。其次，TNM分期不能將腫瘤、淋巴結或轉移納入連續(xù)變量。這就形成了一個有限階段的系統(tǒng)，使個體患者的預后判斷復雜化。第三，TNM系統(tǒng)將預后與描述性變量聯(lián)系起來，而不是決定性變量——它純粹是說，如果你的疾病在發(fā)展過程中在解剖學上進展了，你的預后將會更糟，而不包括其他控制預后的變量(Balachandran VP,Gonen M,Smith JJ,Dematteo RP.Nomograms in oncology:more thanmeets the eye.Lancet Oncology 2015；16:el 73-e80)。鑒于TNM分期的局限性，統(tǒng)計預測模型己發(fā)展到適用于大多數(shù)癌癥類型。這種預測工具之一是列線圖，它創(chuàng)建一個簡單的統(tǒng)計預測模型的圖形來表示，該模型生成臨床事件的數(shù)值概率。對于許多癌癥來說，列線圖與傳統(tǒng)的TNM分期系統(tǒng)相比具有優(yōu)勢，其主要優(yōu)勢之一是能夠根據(jù)患者和疾病特征評估個性化風險。因此被提出作為一種替代甚至一種新的標準。

近年來已有大量研究構建了列線圖(Nomogram)來進一步預測各種惡性腫瘤患者的預后，包括肺癌、乳腺癌、前列腺癌、膀胱癌等。Nomogram不僅經(jīng)常被用于預測所有類型癌癥患者的生存，而且通過納入和說明腫瘤預后的重要因素來成功地量化風險預測。Nomogram與TNM分期系統(tǒng)相比，在許多癌癥中的應用更為精確，因此，Nomogram被認為是一種替代方法，甚至是一種新的標準。通過創(chuàng)建一個統(tǒng)計預測模型的直觀圖形，Nomogram產(chǎn)生了一個臨床事件的數(shù)值概率，如總體生存(OS)。在食管癌中也有類似的研究，但僅僅構建了不同的炎癥指標與食管鱗癌預后的列線圖(Liu JS,Huang Y,Yang X,Feng JF.A nomogramto predict prognostic values of various inflammatory biomarkers in patientswith esophageal squamous cell carcinoma.American Joumal of Cancer Research2015；5:2180.)，不具有代表性。我們假設結合多種臨床病理特征和基因表達可以提高ESCC預后的整體預測，但可靠的基因標記物仍然缺乏。因此本研究中我們?nèi)娣治隹赡苡绊懯彻馨╊A后的各種因素,首次將基因標志物引入到食管癌列線圖中，構建列線圖以期更好的預測食管癌患者的預后。