[發(fā)明專利]一種用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng)及其應用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010055442.1 | 申請日: | 2020-01-17 |
| 公開(公告)號: | CN111128385B | 公開(公告)日: | 2020-11-10 |
| 發(fā)明(設計)人: | 高社干;劉軻;王藝璇;許鋒波;齊義軍 | 申請(專利權)人: | 河南科技大學第一附屬醫(yī)院 |
| 主分類號: | G16H50/30 | 分類號: | G16H50/30;G16B25/00 |
| 代理公司: | 洛陽啟越專利代理事務所(普通合伙) 41154 | 代理人: | 薛布赫 |
| 地址: | 471000 河*** | 國省代碼: | 河南;41 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 食管 預后 預警系統(tǒng) 及其 應用 | ||
1.一種用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng),其特征在于包括數(shù)據(jù)輸入模塊、模型計算模塊和結(jié)果輸出模塊;該系統(tǒng)以患者的年齡、TNM分期、TM9SF1基因表達值、PDZK1IP1基因表達值作為預測因素;
其中,數(shù)據(jù)輸入模塊用于將食管鱗癌患者的年齡、TNM分期、TM9SF1基因表達值、PDZK1IP1基因表達值的檢測結(jié)果輸入模型計算模塊;
模型計算模塊用于根據(jù)食管鱗癌患者points數(shù)值以及生存率模型計算食管鱗癌患者生存率;
模型計算模塊,包括1年生存率模型、3年生存率模型和4年生存率模型中的至少一種;
1年生存率模型包括1年生存率計算公式,1年生存率計算公式如下:
P=-1.5e-08*points^3+-2.556e-06*points^2+0.000244802*points+0.955229796;
3年生存率模型包括3年生存率計算公式,3年生存率計算公式如下:
P=4.9e-08*points^3+-3.2936e-05*points^2+0.002797337*points+0.834350558;
4年生存率模型包括4年生存率計算公式,4年生存率計算公式如下:
P=4.9e-08*points^3+-3.0342e-05*points^2+0.001678317*points+0.873788964;
其中,食管鱗癌患者Points數(shù)值=年齡得分+TNM分期得分+TM9SF1基因表達值得分+PDZK1IP1基因表達值得分;
所述的年齡得分的規(guī)則:年齡≤60=0分,年齡60=32.031分;
所述的TNM分期得分的規(guī)則:I期=0分,II期=53.643分,III期=92.717分;
所述的TM9SF1基因表達值得分的規(guī)則:TM9SF1基因表達值高=0分;TM9SF1表達值低=51.063分;
所述的PDZK1IP1基因表達值得分的規(guī)則:PDZK1IP1基因表達值高=100分;PDZK1IP1表達值低=0分;
結(jié)果輸出模塊,用于根據(jù)食管鱗癌患者生存率結(jié)果來判定食管鱗癌患者預后情況;食管鱗癌患者的生存概率越高,則提示該食管鱗癌患者預后良好、生存期長的可能性越大;
利用survminer軟件包的surv_cutpoint()函數(shù)確定TM9SF1和PDZK1IP1基因的cutoff值,表達值高于cutoff值的,則定義為高表達,低于cutoff值的則定義為低表達。
2.根據(jù)權利要求1所述的用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng),其特征在于:
所述的基因表達值為轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)經(jīng)注釋處理后得到的數(shù)值。
3.根據(jù)權利要求1所述的用于食管鱗癌的預后預警系統(tǒng),其特征在于:
所述的4年生存率模型為:
根據(jù)食管鱗癌患者points數(shù)值直接快速評估食管鱗癌患者4年生存概率,其中,points數(shù)值為0~126,則4年生存概率為70%;points數(shù)值為127~189,則4年生存概率為44%;points數(shù)值為190~229,則4年生存概率為24%;points得分數(shù)值為≥230,則4年生存概率為12%。
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