[發明專利]檢測ABCB1和LDLR基因多態性的引物及探針組合物、試劑盒、方法在審
| 申請號: | 202010052777.8 | 申請日: | 2020-01-17 |
| 公開(公告)號: | CN111154862A | 公開(公告)日: | 2020-05-15 |
| 發明(設計)人: | 劉福平;劉晶晶;鄭建權 | 申請(專利權)人: | 深圳會眾生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 深圳市博銳專利事務所 44275 | 代理人: | 湯星星 |
| 地址: | 518000 廣東省深圳市寶安區航*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 abcb1 ldlr 基因 多態性 引物 探針 組合 試劑盒 方法 | ||
本發明涉及檢測ABCB1和LDLR基因多態性的引物及探針組合物、試劑盒、方法,該檢測ABCB1和LDLR基因多態性的引物及探針組合物包括:用于檢測ABCB1位點的第一引物和第一探針;以及,用于檢測LDLR位點的第二引物和第二探針;其中,第一引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1?4所示,第一探針的核苷酸序列如SEQ ID No.9?10所示;第二引物的核苷酸序列如SEQ ID No.5?8所示,第二探針的核苷酸序列如SEQ ID No.11?12所示。本發明具有檢測通量高、操作簡便、快速且安全的優點。
技術領域
本發明涉及基因檢測技術,特別涉及一種檢測ABCB1和LDLR基因多態性的引物及探針組合物、試劑盒、方法。
背景技術
根據我國流行病學調查,中國成人血脂異常總體患病率在2012年高達40.4%,較10年前呈大幅度上升,而血清總膽固醇(TC)水平的升高將導致未來中國心血管病事件增加約920萬。低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)或TC升高為特點的血脂異常是動脈粥樣硬化性心血管疾病(ASCVD)重要的危險因素,因此降低LDL-C水平,可顯著減少ASCVD的發病及死亡危險。LDL-C每降低1mmol/L(38mg/dL),患主要心血管事件的風險可降低20%,全因死亡率可降低10%,而非心血管事件引起的死亡率并未增加。
他汀類藥物又稱為3-羥甲基-3-甲基戊二酰輔酶A(HMGCo A)還原酶抑制劑,近20多年來的眾多大規模臨床試驗結果顯示,他汀類藥物在ASCVD一級和二級預防中均能顯著降低心血管事件風險,是防治此類疾病最為重要的藥物。然而不同的他汀在化學結構上雖有相似之處,但它們在藥代動力學(吸收、結合血漿蛋白、代謝和溶解度)與其他藥物相互作用、藥物療效以及他汀導致的不良反應方面存在個體間的差異,而這些差異部分是歸因于常見藥物基因的遺傳與變異,ABCB1和LDLR基因則是近年來研究比較多的熱點基因。
三磷酸腺苷結合盒轉運子A1(ABCA1)基因所編碼的ABCA1蛋白在膽固醇的逆向轉運和機體高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)的形成中起到關鍵作用。當ABCA1基因發生突變時,可影響其蛋白質的轉錄和翻譯,從而影響機體血脂水平。在已發現的ABCB1的將近50個SNP中,2677TG和3435CT均能夠影響P-gp的轉運底物,導致阿托伐汀療效的個體化出現差異。相關學者研究發現ABCA1基因多態性與機體血脂異常等疾病存在相關性。
低密度脂蛋白受體(low density lipoprotein receptor,LDLR)由Brown等發現,認為LDLR與血脂代謝異常密切相關。LDLR基因在人類基因組位于第19號染色體短臂末端(19p13.1~13.3),在基因組中的長度為45kb,含有18個外顯子。LDLR基因突變與血脂異常相關性疾病密切相關,LDLR基因的異常表達可導致低密度脂蛋白膽固醇(low densitylipoprotein-cholesterol,LDL-C)的清除障礙,使LDL-C在血漿中極度升高,導致高膽固醇血癥、動脈粥樣硬化(atherosclero-sis,AS)等疾病。在藥物基因組學權威數據庫PharmGKB中顯示LDLR基因突變rs1433099(c.666TC)和rs14158(c.52GA)與他汀類的療效有密切關系。
現有他汀類藥物個體化基因檢測的方法包括PCR-直接測序法、PCR-基因芯片法和熒光定量PCR法等多種方法,每種方法的原理和優缺點如下:
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