本發明提供了鑒定芥藍與紅菜苔種間雜種及其后代材料A05和C04染色體分離情況的分子標記和鑒定方法，屬于植物遺傳育種領域。本發明提供的鑒定芥藍與紅菜苔種間雜種及其后代材料A05和C04染色體分離情況的分子標記和鑒定方法，該標記是一對共顯性分子標記，利用該標記鑒定芥藍與紅菜苔種間雜交真雜種，也可用于鑒定遠緣雜種的自交后代、回交后代、染色體附加系、以及重組分離群體和植株。

技術領域

本發明涉及遺傳育種領域，具體而言，涉及遠緣雜種植物鑒定和選育方法。

背景技術

遠緣雜交是創制植物新種質、拓展育種資源的重要手段。由于物種生殖隔離，遠緣雜交往往需要人工授粉和胚拯救等技術，耗時費力，且需要一定科學訓練。在遠緣雜交過程中，由于去雄不徹底、雌配子發育成植株，以及其他原因可能造成假雜種植株的產生。因而，遠緣雜交獲得的植株需要通過分子、細胞學等方法檢測是否為真雜種。遠緣雜種的自交、回交后代需要通過分子或細胞學方法追蹤染色體或染色體片段，用以創制異源多倍體、染色體附加系、導入系等遺傳材料。與細胞學方法相比，分子標記具有快速、操作簡單、對實驗操作者技術要求低、不需要昂貴儀器、可用于大群體篩查等優點。隨著測序技術的發展，高通量測序和生物芯片也可以用于遠緣雜種的分子檢測。但是，由于簡單快速和成本低廉等原因，分子標記仍然在遠緣雜種快速篩選和大規模群體初篩上具有使用價值。

芥藍是起源于我國的甘藍類蔬菜，具有抗性好、品質優、采收快的優點。是我國南方地區的重要薹用蔬菜。紅菜苔屬于白菜的一個變種，以湖北省武漢市洪山區出產的品質最優。是長江流域的一種特色薹用蔬菜。通過芥藍和紅菜苔遠緣雜交，可以拓展芥藍和紅菜苔的遺傳資源，轉育新性狀，豐富蔬菜類型，豐富人民日常膳食營養。

芥藍的C04和紅菜苔的A05染色體是部分同源(homeologous)染色體。二者之間既含有部分同源區段，也含有大量的物種分化后產生的特異基因。利用芥藍的C04和紅菜苔的A05染色體在雜交后代中的重組可以獲得新的農藝性狀，提高蔬菜的抗病、抗逆、及營養品質。

發明內容

本發明所要解決的技術問題為：如何提供一種鑒定芥藍與紅菜苔種間雜種及其后代材料 A05和C04染色體分離情況的分子標記和鑒定方法，以便能快速、準確的鑒定出芥藍與紅菜苔種間雜種及其后代材料。

本發明的技術方案為：

鑒定芥藍與紅菜苔種間雜種及追蹤其后代材料A05和C04染色體分離情況的SSR分子標記，該SSR分子標記由引物C04a擴增得到，引物C04a的前向引物序列為C04a-F:5’-TCCGGAACTCATGAATGCTT-3’(SEQ ID No.1)；引物C04a的后向引物序列為C04a- R:5’-TTTTGGGTGCCTCGTGTAAT-3’(SEQ ID No.2)。

該分子標記PCR片段預期長度：250-270bp。真實的，紅菜苔(A)基因組中擴增片段的預期長度為263bp，芥藍(C)基因組中的擴增片段預期長度為254bp。應當知道，不同品種間SSR重復數可能不同，擴增片段長度在不同品種間可以有差異。

分子標記在芥藍和紅菜苔的染色體位置：在紅菜苔(A)基因組中位于第5染色體1.2 Mb處(根據Chiifu白菜V1.0基因組；下載地址： http://brassicadb.org/brad/datasets/pub/BrassicaceaeGenome/Brassica_rapa/V1.0/)，在芥藍(C) 基因組中位于第4染色體0.63Mb處(根據甘藍Bol_Chromosome_V1.1基因組；下載地址： http://brassicadb.org/brad/datasets/pub/BrassicaceaeGenome/Brassica_oleracea/Bol_Chromosome_ V1.1/)。應當知道，由于不同研究者對染色體的編號可能不同，不同基因組組裝版本中該標記位置也可能不同，本專利應當包括檢測編號不同但實質等同的染色體及位置。