[發明專利]產生復數候選探針和鑒定哺乳動物中細胞類型的方法在審
| 申請號： | 201880047117.1 | 申請日： | 2018-07-16 |
| 公開（公告）號： | CN111094594A | 公開（公告）日： | 2020-05-01 |
| 發明（設計）人： | 黃培瑛 | 申請（專利權）人： | 茂英基因科技股份有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6886 | 分類號： | C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 上海德昭知識產權代理有限公司 31204 | 代理人： | 郁旦蓉 |
| 地址： | 中國臺灣臺北市大安*** | 國省代碼： | 臺灣;71 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 產生 復數 候選 探針 鑒定 哺乳動物 細胞 類型 方法 | ||
1.一種產生復數候選探針的方法，用于辨識哺乳動物中細胞類型的方法，其特征在于，其包含：
步驟(a)通過偵測芯片從所述哺乳動物的標準樣本中產生復數基因表現；
步驟(b)通過處理模塊比較所述復數基因表現以產生比較結果；以及
步驟(c)根據所述比較結果轉化出包含所述復數候選探針的矩陣，其中所述復數候選探針可以結合至任一復數多核苷酸序列選自SEQ ID No：1～652或SEQ ID No：1～652的任一片段，
其中，所述偵測芯片與所述處理模塊彼此電訊連接。
2.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述復數候選探針的數量為200個。
3.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述復數候選探針的數量為100個。
4.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述復數候選探針的數量為50～60個。
5.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述復數候選探針的數量為25～35個。
6.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述復數探針的長度為至少15個核苷酸。
7.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述標準樣本是一個被診斷為不患有特定疾病、失調、基因癥狀或上述任意的組合。
8.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述標準樣本是一個被診斷為患有特定疾病、失調、基因癥狀或上述任意的組合。
9.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述標準樣本包含血液、血漿、血清、尿液、組織、細胞、器官、體液或上述任意的組合。
10.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述步驟(b)不包含將所述標準樣本中的所述復數基因表現與一個被診斷為患有特定疾病、失調、基因癥狀或上述任意的組合的受試者異常樣本中的復數基因表現進行比較。
11.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，在所述步驟(c)中產生所述矩陣的方法包含：皮爾生相關系數、斯皮爾曼等級相關系數、肯德爾等級相關系數、K平均、馬哈蘭距離、漢明距離、萊文斯坦距離、歐幾里得距離或上述任意的組合。
12.如權利要求1所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述步驟(c)還包含：
步驟(c1)分析所述復數候選探針的特定序列與所述任一復數多核苷酸序列選自SEQID No：1～652或SEQ ID No：1～652的任一片段的表現量之間的相關性因子。
13.如權利要求12所述的產生復數候選探針的方法，其特征在于：其中，所述相關性因子包含結合親和力。
14.一種鑒定哺乳動物中細胞類型的方法，其特征在于，其包含：
步驟(a')通過一個包含如權利要求1～5的任意一項中所述復數候選探針的偵測芯片偵測患有特定疾病、失調或基因病變的哺乳動物測試樣本中矩陣的表現，其中所述復數候選探針可以與如權利要求1～5的任意一項中任一復數多核苷酸序列選自SEQ ID NO：1～652或SEQ ID NO：1～652的任一片段結合；
步驟(b')通過處理模塊并且依據偵測的所述表現分析所述測試樣本以產生測試樣本分數；以及
步驟(c')通過所述處理模塊且依據所述測試樣本分數預測所述測試樣本的細胞類型。
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