[發(fā)明專利]一種生物分析平臺中的項目實施質(zhì)控系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710792133.0 | 申請日: | 2017-09-05 |
| 公開(公告)號: | CN107609349A | 公開(公告)日: | 2018-01-19 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 李山;莊振華;胡濤;李良波;王其;白麗軍;楊斌 | 申請(專利權(quán))人: | 成都生命基線科技有限公司 |
| 主分類號: | G06F19/22 | 分類號: | G06F19/22;G06Q10/06;G06Q10/10 |
| 代理公司: | 成都行之專利代理事務(wù)所(普通合伙)51220 | 代理人: | 郭受剛 |
| 地址: | 610000 四川省成都市高新區(qū)天*** | 國省代碼: | 四川;51 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 生物 分析 平臺 中的 項目 實施 系統(tǒng) | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及鐵路接觸網(wǎng)檢測領(lǐng)域,具體地,涉及一種生物分析平臺中的項目實施質(zhì)控系統(tǒng)。
背景技術(shù)
生物信息分析項目是分析基因序列中表達(dá)的結(jié)構(gòu)功能特征,需要根據(jù)科學(xué)研究目的,利用計算機(jī)對生物信息進(jìn)行儲存、檢索和分析。整個項目涉及到生物學(xué)、計算機(jī)、數(shù)學(xué)等多個學(xué)科,如何對項目質(zhì)量的實際情況進(jìn)行準(zhǔn)確度量、如何控制項目進(jìn)度質(zhì)量、如何反饋項目技術(shù)問題并采取糾偏措施顯得非常重要。
傳統(tǒng)的企業(yè)沒有采用在線的互聯(lián)網(wǎng)平臺的模式來做多層次的質(zhì)量控制,多是企業(yè)內(nèi)部的工作流程,相對來說存在以下的問題:
1.僅供企業(yè)內(nèi)部人員了解,客戶不能實時查看信息,導(dǎo)致項目信息溝通的封閉和滯后;
2.不是作為第三方的質(zhì)控平臺,可能存在質(zhì)控上的不嚴(yán)格;
3.很多企業(yè)沒有專業(yè)人員進(jìn)行質(zhì)控,也沒有在項目實施的每一個重要節(jié)點進(jìn)行與客戶的交互,征詢意見。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提供了一種生物分析平臺中的項目實施質(zhì)控系統(tǒng),解決了傳統(tǒng)的生物信息分析項目質(zhì)量無法有效控制的技術(shù)問題,實現(xiàn)了通過本系統(tǒng)能夠有效對生物信息分析項目質(zhì)量進(jìn)行控制的技術(shù)效果。
為實現(xiàn)上述發(fā)明目的,本申請?zhí)峁┝艘环N生物分析平臺中的項目實施質(zhì)控系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括:
分配單元,用于基于用戶的生物信息分析項目信息自動分配相應(yīng)的平臺支持單元;
平臺支持單元,用于基于數(shù)據(jù)庫中預(yù)設(shè)的生物信息領(lǐng)域技術(shù)信息,對用戶的生物信息分析項目信息進(jìn)行分析,生成生物信息分析項目發(fā)布需求信息;
項目發(fā)布單元,用于基于生成的生物信息分析項目發(fā)布需求信息,發(fā)布相應(yīng)的生物信息分析項目;
項目實施單元,用于工程師接受發(fā)布的生物信息分析項目,并將完成的信息上傳;
評審單元,用于基于生物信息分析項目評審規(guī)則對工程師上傳的信息進(jìn)行評審,生成相應(yīng)的評審信息,并將評審信息發(fā)送至相應(yīng)的客戶。
進(jìn)一步的,所述項目實施單元具體包括:
拆分單元,用于將生物信息分析項目拆分為多個階段性生物信息分析子項目;
上傳單元,用于工程師上傳完成的階段性生物信息分析子項目;
檢測單元,用于對上傳的階段性生物信息分析子項目進(jìn)行檢測,并將檢測結(jié)果反饋給相應(yīng)的工程師。
其中,平臺支持單元為通過大數(shù)據(jù)采集建立數(shù)據(jù)庫,通過采集大量的生物信息分析技術(shù)員相關(guān)的專業(yè)信息,利用采集的信息建立相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫,用于在系統(tǒng)運行時進(jìn)行支持。
進(jìn)一步的,所述系統(tǒng)還包括評分單元,用于用戶基于工程師上傳的生物信息分析項目質(zhì)量對相應(yīng)的工程師進(jìn)行評分。
進(jìn)一步的,所述系統(tǒng)還包括分析內(nèi)容選擇單元,用于選擇生物信息分析項目的標(biāo)準(zhǔn)化分析或個性化分析。
進(jìn)一步的,對Small RNA(小RNA)測序分析時,標(biāo)準(zhǔn)化分析內(nèi)容為:a、數(shù)據(jù)過濾質(zhì)控及統(tǒng)計;b、Small RNA長度分布統(tǒng)計;c、品間的公共序列和特異序列的分析;d、Small RNA在選定的參考基因組上的分布;e、Small RNA與rRNA(核糖體RNA)、tRNA(轉(zhuǎn)運RNA)、snRNA(細(xì)胞內(nèi)有小核RNA)、snoRNA(核仁小分子RNA)的比對信息;f、Small RNA與重復(fù)序列的比對信息;
個性化分析內(nèi)容包括:a、已知miRNA(micro RNA,微小RNA)和novel miRNA(新的微小RNA)的靶基因預(yù)測;b、已知miRNA和Novel miRNA靶基因GO(Gene Onotology,基因本體)注釋和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因與基因組百科全書);c、已知miRNA的堿基編輯分析;d、已知miRNA差異分析和聚類分析;e、novel miRNA差異分析和聚類分析;f、差異miRNA靶基因預(yù)測;g、差異miRNA靶基因GO注釋和KEGG通路分析。
Small RNA:Small RNA是指在生物體中表達(dá)的,不編碼蛋白,長度較短(18~30nt或40nt)的RNA分子,參與誘導(dǎo)基因沉默,參與細(xì)胞生長、發(fā)育、基因轉(zhuǎn)錄和翻譯等諸多生命活動的調(diào)控過程。主要包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。家族成員眾多。
miRNA:microRNA,簡稱miRNA,是目前功能研究較為透徹的一類小RNA(20~25nt)。miRNA通過與特定mRNA的結(jié)合調(diào)節(jié)相應(yīng)基因的表達(dá),這些基因稱為該mRNA的靶基因。
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G06F 電數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)處理
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G06F19-14 ..用于發(fā)展或進(jìn)化的,例如:進(jìn)化的保存區(qū)域決定或進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的,例如:結(jié)構(gòu)排序,結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系,蛋白質(zhì)折疊,結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶,涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的,例如:基因型–表型關(guān)聯(lián),不均衡連接,種群遺傳學(xué),結(jié)合位置鑒定,變異發(fā)生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用





