[發明專利]一種生物分析平臺中的項目實施質控系統在審
| 申請號: | 201710792133.0 | 申請日: | 2017-09-05 |
| 公開(公告)號: | CN107609349A | 公開(公告)日: | 2018-01-19 |
| 發明(設計)人: | 李山;莊振華;胡濤;李良波;王其;白麗軍;楊斌 | 申請(專利權)人: | 成都生命基線科技有限公司 |
| 主分類號: | G06F19/22 | 分類號: | G06F19/22;G06Q10/06;G06Q10/10 |
| 代理公司: | 成都行之專利代理事務所(普通合伙)51220 | 代理人: | 郭受剛 |
| 地址: | 610000 四川省成都市高新區天*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 生物 分析 平臺 中的 項目 實施 系統 | ||
1.一種生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,所述系統包括:
分配單元,用于基于用戶的生物信息分析項目信息自動分配相應的平臺支持單元;
平臺支持單元,用于基于數據庫中預設的生物信息領域技術信息,對用戶的生物信息分析項目信息進行分析,生成生物信息分析項目發布需求信息;
項目發布單元,用于基于生成的生物信息分析項目發布需求信息,發布相應的生物信息分析項目;
項目實施單元,用于工程師接受發布的生物信息分析項目,并將完成的信息上傳;
評審單元,用于基于生物信息分析項目評審規則對工程師上傳的信息進行評審,生成相應的評審信息,并將評審信息發送至相應的客戶。
2.根據權利要求1所述的生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,所述項目實施單元具體包括:
拆分單元,用于將生物信息分析項目拆分為多個階段性生物信息分析子項目;
上傳單元,用于工程師上傳完成的階段性生物信息分析子項目;
檢測單元,用于對上傳的階段性生物信息分析子項目進行檢測,并將檢測結果反饋給相應的工程師。
3.根據權利要求1所述的生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,所述系統還包括評分單元,用于用戶基于工程師上傳的生物信息分析項目質量對相應的工程師進行評分。
4.根據權利要求1所述的生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,所述系統還包括分析內容選擇單元,用于選擇生物信息分析項目的標準化分析或個性化分析。
5.根據權利要求4所述的生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,對Small RNA測序分析時,標準化分析內容為:a、數據過濾質控及統計;b、Small RNA長度分布統計;c、品間的公共序列和特異序列的分析;d、Small RNA在選定的參考基因組上的分布;e、Small RNA與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比對信息;f、Small RNA與重復序列的比對信息;
個性化分析內容包括:a、已知miRNA和novel miRNA的靶基因預測;b、已知miRNA和Novel miRNA靶基因GO注釋和KEGG;c、已知miRNA的堿基編輯分析;d、已知miRNA差異分析和聚類分析;e、novel miRNA差異分析和聚類分析;f、差異miRNA靶基因預測;g、差異miRNA靶基因GO注釋和KEGG通路分析。
6.根據權利要求1所述的生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,所述項目實施單元還用于工程師基于生物信息分析項目,生成項目實施計劃,并將項目實施計劃發送給客戶。
7.根據權利要求6所述的生物分析平臺中的項目實施質控系統,其特征在于,Small RNA測序分析時,項目實施單元生成的的項目實施計劃為:
A、建庫測序,具體步驟包括:取樣、樣品檢測、建庫測序、上機測序、測序結果下機;
B、標準化分析,具體步驟包括:質控、比對、sRNA表達水平計算;
C、個性化分析,具體步驟包括:靶基因預測、差異分析、通路分析。
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