[發明專利]一種高保真DNA聚合酶及其制備和應用有效
| 申請號: | 201310268966.9 | 申請日: | 2013-06-28 |
| 公開(公告)號: | CN104250641B | 公開(公告)日: | 2017-09-01 |
| 發明(設計)人: | 葛猛;夏霞宇;余倩;王宏偉 | 申請(專利權)人: | 北京福安華生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N9/12 | 分類號: | C12N9/12;C12N15/54;C12N15/70;C12N15/10 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 高保真 dna 聚合 及其 制備 應用 | ||
技術領域
本發明屬于基因工程領域,涉及一種高保真DNA聚合酶及其制備和應用。
背景技術
DNA聚合酶廣泛應用于分子生物學研究中,如DNA測序、標記、突變和核酸擴增等反應。耐熱DNA聚合酶由于其熱穩定性,在核酸高溫變性的條件下不會失活,是目前核酸擴增的常用酶。根據序列的不同,DNA聚合酶可以分為六大族:A、B、C、D、X和Y,耐熱DNA聚合酶主要屬于A族和B族,并具有相似的生物學性質。A族DNA聚合酶的代表是Taq DNA聚合酶,該聚合酶分離自Thermus aquaticus YT-1的基因組,具有5’-3’的DNA外切酶活性和5’-3’DNA聚合酶活性,其菌株生長于75℃左右的溫泉中,由于其能耐受高溫變性,自發現后被廣泛應用于PCR反應,目前已被開發成多種試劑盒;后來的研究又從其他物種中分離出了多種A族DNA聚合酶,但由于其不具有3’-5’的外切酶校正活性,容易在擴增時摻入錯誤的堿基,導致不能忠實地擴增模板,直到B族DNA聚合酶的發現,才使得高保真地擴增模板成為可能。B族DNA聚合酶主要分離自古細菌,包括廣古菌、泉古菌、納古菌和初古菌,其具有更高的熱穩定性,同時其3’-5’外切酶校正活性能識別錯誤摻入延伸鏈中的堿基,并將其切下,利用DNA聚合酶活性添加為與模板互補的堿基,從而保證了新擴增鏈與模板的高度一致性。
超嗜熱古菌具有嚴格厭氧和超嗜熱生長的特性,如Pyrodictium和Methanopyrus屬的物種能在110℃生長,而低于80℃則不能生長;從大西洋中脊3650米的超熱煙囪中分離的Pyrolobus fumarii是目前已知最耐熱的古菌,其能在高達113℃的高溫條件下增值,而低于90℃則停止生長。目前已經從Pyrococcus和Thermococcus屬中分離出了許多DNA聚合酶,某些DNA聚合酶在極高的溫度下仍能保持穩定,被應用于分子生物學研究,尤其是核酸擴增中。其中,Pfu DNA聚合酶是一種來源于Pyrococcus furiosus的熱穩定的DNA聚合酶,具有5’-3’DNA聚合酶活性和3’-5’的外切酶活性。由于Pfu DNA聚合酶有3’-5’的外切酶活性,因此在核酸擴增過程中出錯的機率大大降低,保真性約為Taq DNA聚合酶的6倍。目前,Pfu DNA聚合酶通常作為首選的高保真DNA聚合酶,用于核酸的高保真擴增,但是,在實際應用過程中,Pfu DNA聚合酶對引物和樣品的結構、純度和濃度要求比較高,反應靈敏度較低,擴增效率較低,限制了Pfu DNA聚合酶的使用和推廣。
發明內容
有鑒于此,本發明的目的在于提供一種高靈敏度、高擴增效率的高保真DNA聚合酶及其制備和應用。
為了實現本發明的目的,本發明采用如下的技術方案:
本發明提供了一種高保真DNA聚合酶,命名為Tco DNA聚合酶,其具有(Ⅰ)、(Ⅱ)所示的氨基酸序列中任意一個:
(Ⅰ)具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;
(Ⅱ)具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列經取代、缺失或添加一個或多個氨基酸獲得的氨基酸序列。
本發明提供了一種Tco DNA聚合酶在核酸擴增中的應用,Tco DNA聚合酶具有(Ⅰ)、(Ⅱ)所示的氨基酸序列中任意一個:
(Ⅰ)具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;
(Ⅱ)具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列經取代、缺失或添加一個或多個氨基酸獲得的氨基酸序列。
本發明提供了一種編碼Tco DNA聚合酶的DNA分子,其具有Ⅰ、Ⅱ所示的核苷酸序列中任意一個:
Ⅰ具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;
Ⅱ具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列經取代、缺失或添加一個或多個堿基獲得的核苷酸序列;
Tco DNA聚合酶具有(Ⅰ)、(Ⅱ)所示的氨基酸序列中任意一個:
(Ⅰ)具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;
(Ⅱ)具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列經取代、缺失或添加一個或多個氨基酸獲得的氨基酸序列。
本發明提供了一種重組載體,其含有編碼Tco DNA聚合酶的DNA分子,該DNA分子具有具有Ⅰ、Ⅱ所示的核苷酸序列中任意一個:
Ⅰ具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;
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