[發明專利]基于證據的胃癌預后分子標記物篩選方法有效
| 申請號: | 201310237953.5 | 申請日: | 2013-06-13 |
| 公開(公告)號: | CN103310129B | 公開(公告)日: | 2017-03-01 |
| 發明(設計)人: | 余科;張珊珊;譚海清;宓婭娜;趙凌云 | 申請(專利權)人: | 浙江大學 |
| 主分類號: | G06F19/24 | 分類號: | G06F19/24 |
| 代理公司: | 杭州中成專利事務所有限公司33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 證據 胃癌 預后 分子 標記 篩選 方法 | ||
1.基于證據的胃癌預后分子標記物篩選方法,其特征是包括以下步驟:?
1)、為胃癌預后生物標記物的實驗研究制定納入標準:
包括在研究設計、研究人群、臨床效應指標、生物標記物種類這些方面進行限制;
2)、制定研究證據檢索策略:
全面而系統地檢索臨床研究證據數據庫,包括PubMed、Embase、中國生物醫學文獻數據庫(CBM),萬方數據庫和中國知識資源總庫(CNKI);只檢索以人為研究對象的研究,研究類型和出版語言不受限制;檢索納入研究的參考文獻;
3)、初步篩選預后生物標記物:
將檢索到的研究證據按照納入標準,確定胃癌預后生物標記物的種類和數量,構建生物標記物數據庫;
生物標記物按照研究設計方法、研究的數量和研究的樣本量進行篩選,篩選出滿足以下任意一個條件的生物標記物:(1)具有隨機對照實驗;(2)研究數量≥3并且研究樣本量≥500;
4)、研究資料提取:
由2名研究者按照預先制定的研究資料提取內容及標準獨立進行資料提取以及交叉核對,確保研究資料提取和質量評價的結果具有一致性,意見不一致時交由第3位研究者確定;
5)、?試驗研究質量評估:
使用Newcastle-Ottawa?Scale對納入的研究進行質量評估,包括評價患者選擇、退出隨訪、確認生物標記物狀態的準確性、診斷準確性、預后指標評估的準確性和控制混雜因素的準確性;
6)、?標準化數據處理:
采用標準化統計策略,合并測量指標,評估生物標記物對胃癌預后的效能和價值;若存在系統綜述和Meta分析研究,直接將數據列入最終結果,否則進行統計分析;標準化統計策略主要包括:Meta分析,亞組分析,敏感性分析,Meta回歸分析,異質性評估,累積Meta分析,發表偏倚評估;
7)、?預后生物標記物篩選:
經過標準化數據處理的胃癌預后生物標記物研究,按照研究設計方法、研究質量、樣本量、預后指標結果的顯著性進行篩選,獲得具有潛在應用價值的胃癌預后生物標記物;
8)、?根據篩選標準,篩選出具有潛在應用價值的胃癌預后生物標記物,并描述預后價值。
2.根據權利要求1所述的基于證據的胃癌預后分子標記物篩選方法,其特征是:
所述步驟7)的篩選標準如下:(1)具有一系列隨機對照實驗研究,合并樣本量≧500例,OS、臨床病理特征、PFS、復發、毒性等預后指標顯著(p<0.05),無發表偏倚(p>0.05);(2)只有單篇隨機對照實驗研究,樣本量≥300例,失訪率<20%,研究質量高,OS、臨床病理特征、PFS、復發、毒性等預后指標顯著(p<0.05);(3)具有多個實驗研究,合并樣本量≥1000,OS、臨床病理特征、PFS、復發、毒性等預后指標顯著(p<0.05),無發表偏倚(p>0.05);(4)只有單個多中心大樣本研究,樣本量≧500例,失訪率<20%,研究質量高,OS、臨床病理特征、PFS、復發、毒性等預后指標顯著(p<0.05)。
3.根據權利要求1或2所述的基于證據的胃癌預后分子標記物篩選方法,其特征是:
所述步驟1)為:
所述證據納入標準為:(1)研究人群為胃癌患者;(2)評估生物標記物與臨床效應指標之間的關系,臨床效應指標必須是總體生存期(OS)、無進展生存期(PFS)、化療藥物敏感性、復發、毒副作用、臨床病理特征等中的一種或幾種;(3)生物標記物為基因突變、基因多態性、mRNA表達水平、蛋白表達水平、microRNA和微衛星中的一種或幾種;(4)提供明確的生物標記物檢測方法;(5)研究設計必須隨機對照實驗、橫截面研究、隊列研究或者系統綜述(滿足上述至少一種),分為前瞻性研究和回顧性研究;
排除下列研究:(1)沒有對照組;(2)無分子標記物檢測方法;(3)重復的研究;(4)細胞或者動物實驗;(5)綜述文章;(6)沒有研究生物標記物與胃癌預后關系。
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