[發明專利]慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針和引物、及其試劑盒有效
| 申請號: | 201310079019.5 | 申請日: | 2013-03-12 |
| 公開(公告)號: | CN103131788A | 公開(公告)日: | 2013-06-05 |
| 發明(設計)人: | 陳棟;汪黎明;張潔;馮坤 | 申請(專利權)人: | 上海市口腔病防治院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海光華專利事務所 31219 | 代理人: | 許亦琳;余明偉 |
| 地址: | 200001 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 慢性 牙周炎 相關 核苷酸 多態性 檢測 探針 引物 及其 試劑盒 | ||
1.慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,包括單核苷酸多態性位點rs2891168的特異性擴增引物對、單核苷酸多態性位點rs1800796的特異性擴增引物對、單核苷酸多態性位點rs2891168的檢測探針,以及單核苷酸多態性位點rs1800796的檢測探針。
2.如權利要求1所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,
所述rs2891168的特異性擴增引物對包括核苷酸序列為SEQ?ID?NO:1的上游引物和核苷酸序列為SEQ?ID?NO:2的下游引物;
所述rs1800796的特異性擴增引物對包括核苷酸序列為SEQ?ID?NO:3的上游引物和核苷酸序列為SEQ?ID?NO:4的下游引物;
所述rs2891168的檢測探針包括核苷酸序列為SEQ?ID?NO:5的5’端野生型探針、核苷酸序列為SEQ?ID?NO:6的5’端突變型探針以及核苷酸序列為SEQ?ID?NO:7的3’端common探針;
所述rs1800796的檢測探針包括核苷酸序列為SEQ?ID?NO:8的5’端野生型探針、核苷酸序列為SEQ?ID?NO:9的5’端突變型探針以及核苷酸序列為SEQ?ID?NO:10的3’端common探針。
3.如權利要求2所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述rs2891168的3’端common探針及rs1800796的3’端common探針的5’端攜帶熒光基團。
4.如權利要求3所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述熒光基團為Cy3。
5.如權利要求2所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物還包括rs2891168野生型Zip探針、rs2891168突變型Zip探針、rs1800796野生型Zip探針及rs1800796突變型Zip探針,且各Zip探針的序列互不相同。
6.如權利要求5所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述rs2891168野生型Zip探針、rs2891168突變型Zip探針、rs1800796野生型Zip探針及rs1800796突變型Zip探針的核苷酸序列選自SEQ?ID?NO:11-SEQ?ID?NO:14。
7.如權利要求6所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述rs2891168野生型Zip探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:11,rs2891168突變型Zip探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:12、rs1800796野生型Zip探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:13,rs1800796突變型Zip探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:14。
8.如權利要求5-7任一所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述rs28911685’端野生型探針、rs28911685’端突變型探針、rs18007965’端野生型探針及rs18007965’端突變型探針的末端均連接有cZip寡核苷酸片段,所述rs28911685’端野生型探針、rs28911685’端突變型探針、rs18007965’端野生型探針及rs18007965’端突變型探針的末端連接的cZip寡核苷酸片段的序列分別與所述rs2891168野生型Zip探針、rs2891168突變型Zip探針、rs1800796野生型Zip探針及rs1800796突變型Zip探針的序列相互補。
9.如權利要求8所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用探針與引物,其特征在于,所述cZip寡核苷酸片段連接于5’端野生型探針及5’端突變型探針的5’端。
10.如權利要求1-9任一權利要求所述的探針與引物的用途,為用于制備慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用試劑盒。
11.如權利要求10所述的用途,其特征在于,所述慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用試劑盒為中國漢族人群慢性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用試劑盒。
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