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[發明專利]一種高靈敏、快速定量檢測T4 PNK酶的方法在審

專利信息
申請號: 201910738896.6 申請日: 2019-08-12
公開(公告)號: CN110514631A 公開(公告)日: 2019-11-29
發明(設計)人: 胡琴;岑瑤;柴煜瑩;許貫虹;魏芳弟;楊靜 申請(專利權)人: 南京醫科大學
主分類號: G01N21/64 分類號: G01N21/64
代理公司: 32200 南京經緯專利商標代理有限公司 代理人: 曹翠珍<國際申請>=<國際公布>=<進入
地址: 210029 *** 國省代碼: 江蘇;32
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摘要:
搜索關鍵詞: 熒光 裂解 靈敏 退火 熒光素標記 催化磷酸 定量檢測 多核苷酸 合成金屬 快速定量 配位中心 有機骨架 有機配體 激酶 互補鏈 磷酸化 酶活性 檢測 雙鏈 猝滅 培育
【說明書】:

發明公開了一種高靈敏、快速定量檢測T4多核苷酸激酶的方法,步驟是:(1)以Fe3+為配位中心,BDC為有機配體,合成金屬有機骨架Fe?MIL?88;(2)將熒光素標記的DNA單鏈FAM?ssDNA與其互補鏈退火形成雙鏈FAM?dsDNA;(3)FAM?dsDNA經培育后,被T4 PNK催化磷酸化,磷酸化的FAM?dsDNA被λ exo裂解得到FAM?ssDNA;(4)加入Fe?MIL?88,裂解得到FAM?ssDNA熒光被猝滅,通過檢測FAM的熒光強度來定量檢測T4 PNK酶活性。靈敏簡便,選擇性好。

技術領域

本發明屬納米材料、熒光傳感技術和生物分析檢測領域,具體涉及基于偶聯核酸外切酶反應和金屬有機骨架(MOFs)—Fe-MIL-88的熒光傳感納米平臺用于定量測定細胞裂解液中T4多核苷酸激酶(T4 PNK)的方法。

背景技術

T4多核苷酸激酶(T4 PNK)是由T4噬菌體所感染的大腸桿菌分離出來的酶。多核苷酸激酶(PNK)能夠催化三磷酸腺苷(ATP)的γ-磷酸基團轉移到DNA或RNA的5′-OH末端并生成ADP的反應。在大多數正常的細胞活動包括DNA重組、復制、修復過程中,該磷酸化反應是一個必不可少的過程。一般來說,各種外源性和內源性因素包括電離輻射、化學物質和核酸酶等都可能導致核酸中5'端羥基化,從而損傷DNA,使基因組不穩定。多核苷酸激酶通過轉移ATP的γ-磷酸基團至DNA末端從而負責修復核酸的5′端羥基自由基。PNK功能障礙可能導致許多細胞活動發生異常,如核酸代謝、DNA復制、DNA重組、DNA鏈損傷修復異常等,最終誘發多種人類疾病,包括沃納綜合征、Rothmund-Thomson綜合征等。此外,由于PNK抑制劑能夠提高人體腫瘤對γ-射線的敏感性,PNK可能為癌癥放射治療的一個有重大潛力的靶點。因此,建立一種高靈敏性,選擇性好,便于操作的PNK活性檢測及其抑制劑篩選的方法對基礎生化研究、臨床診斷和藥物發現具有重要意義。

目前,用于檢測PNK活性的常規分析方法主要包括聚丙烯酰胺凝膠電泳、放射自顯影、自由基同位素32p標記技術等,但這些方法存在復雜、耗時、潛在的放射性危害等缺陷。近年來,納米通道生物傳感器、電化學方法、比色法、熒光法等逐漸引起關注,其中熒光法以其簡便、高效、靈敏等優點越來越受到人們的重視。

近年來,金屬有機骨架材料(MOFs)作為一種具有晶體多孔性的新型材料,以其生物降解性、高比表面積和靈活可控的孔隙度,顯示出了巨大的應用潛力。MOFs的常見應用包括氣體儲存、催化和藥物傳遞。此外,利用MOFs具有良好的猝滅能力,可以用于構建熒光傳感平臺。MOFs通常對單鏈DNA(ssDNA)顯示良好的吸附作用。這是由于MOFs包含的有機基團通常存在π電子共軛體系產生π-π相互作用的結果,同時為可能的氫鍵提供來源。然而,利用MOFs進行酶活性檢測的例子很少,因此利用MOFs進行酶活性檢測的應用尚待進一步探索。

發明內容

針對現有技術存在的設計復雜、操作繁瑣、費用高等缺陷,本發明的目的在于提供一種基于偶聯核酸外切酶反應和MOFs(Fe-MIL-88)的用于高靈敏、快速定量檢測T4多核苷酸激酶的方法。利用λ exo對磷酸化DNA的裂解作用、Fe-MIL-88對ssDNA和雙鏈DNA(dsDNA)的吸附能力的明顯區別及其良好的熒光猝滅能力,檢測細胞裂解液中T4 PNK酶活性。

為了實現上述發明目的,本發明采用的技術方案為:

一種快速定量檢測T4 PNK酶的方法,步驟如下:

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