1.一種植物基因組差異甲基化區域的檢測方法，其特征在于，包括以下步驟：

1)通過植物全基因組甲基化測序獲得處理組全基因組上單位點甲基化數據和對照組全基因組上單位點甲基化數據；

2)分別讀取處理組全基因組上單位點甲基化信息和對照組全基因組上單位點甲基化信息，將讀取的兩組全基因組上單位點甲基化信息分區段儲存，得到全基因組每一區段的甲基化信息；

3)以200bp為一個窗口，以50bp為步長滑動窗口掃描所述全基因組每一區段的甲基化信息，將掃描得到的全基因組每一區段的甲基化信息分區段儲存到python字典中；

所述兩組全基因組上差異甲基化區域的甲基化信息包括染色體，區域，甲基化類型，每一種甲基化類型對應的胞嘧啶位點數量，每一種甲基化類型對應的胞嘧啶位點數量所支持的甲基化reads數量、每一種甲基化類型對應的胞嘧啶位點數量所不支持的甲基化reads數量和每一種甲基化類型對應的胞嘧啶位點數量所支持與不支持甲基化reads數量的總和；其中區域號的設置方法為以步長50bp為一個區域，從0開始編號，每移動一個區域順延一個編號；所述甲基化類型包括CG類型、CHG類型或CHH類型；所述全基因組上差異甲基化區域的甲基化信息的儲存形式為3層字典儲存；最外側鍵的名稱為染色體；從外向內數第二層鍵的名稱為區域；從外向內數第三層鍵的名稱為甲基化類型；最內層鍵為所述區域內每一種甲基化類型對應的胞嘧啶位點數量所支持的甲基化reads數量、所述區域內每一種甲基化類型對應的胞嘧啶位點數量所不支持的甲基化reads數量和所述區域內每一種甲基化類型胞嘧啶位點數量的總和；

4)對步驟3)中存儲在python字典中的全基因組每一區段的甲基化信息進行預篩選、Fisher檢驗、FDR校正和再篩選，得到有效全基因組上單位點甲基化信息；

5)根據所述有效全基因組上單位點甲基化信息，統計每個窗口中各區段的甲基化信息。