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[發(fā)明專利]CLIP3基因的SNP位點的應(yīng)用有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201811091122.0 申請日: 2018-09-19
公開(公告)號: CN109097465B 公開(公告)日: 2021-06-08
發(fā)明(設(shè)計)人: 蒲佐 申請(專利權(quán))人: 蒲佐
主分類號: C12Q1/6883 分類號: C12Q1/6883
代理公司: 北京慧尚知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 11743 代理人: 鮑曉芳
地址: 518020 廣東省深圳*** 國省代碼: 廣東;44
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: clip3 基因 snp 應(yīng)用
【說明書】:

發(fā)明公開了一種基于全外顯子測序技術(shù)篩選與主動脈夾層疾病相關(guān)的SNP位點,所述SNP位點包括以下主動脈夾層易感性SNP位點:CLIP3:NM_001199570:exon1:c.32CT:p.P11L。進一步,本發(fā)明提供所述SNP位點在檢測主動脈夾層疾病的檢測產(chǎn)品中的應(yīng)用。本發(fā)明通過發(fā)現(xiàn)了一個主動脈夾層易感SNP位點并研究了其在主動脈夾層早期預(yù)測的應(yīng)用前景,本發(fā)明提供的主動脈夾層相關(guān)的基因位點可能是主動脈夾層的早期生物標(biāo)志物,為進一步研究主動脈夾層的遺傳分子機制,探索主動脈夾層早期防治的藥物靶點提供了新的方向。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)檢測技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及與主動脈夾層疾病相關(guān)的CLIP3基因的SNP位點的應(yīng)用。

背景技術(shù)

主動脈夾層(Aortic Dissection,AD)系指主動脈在一系列外在因素作用下(如高血壓、外傷等因素),基于主動脈壁本身存在或不存在病變,主動脈內(nèi)膜出現(xiàn)破口,血液自主動脈內(nèi)膜破口侵入主動脈壁的中層,主動脈中層不斷撕裂、縱向分離,導(dǎo)致呈現(xiàn)出一種主動脈管腔真假兩腔并存的狀態(tài)。主動脈夾層起病急驟,發(fā)展迅速,預(yù)后兇險。盡管目前的各種治療手段不斷改進,但是AD的發(fā)病率和死亡率依然居高不下,并且如果不進行恰當(dāng)和及時的治療,AD死亡率極高。有報道稱約有近20%的AD患者在到達醫(yī)院之前死亡,而30%的患者在住院治療期間死亡。目前臨床上對AD缺乏有效的藥物干預(yù)手段,主要采用外科手術(shù)進行血管置換、介入手術(shù)進行主動脈腔內(nèi)支架植入以及兩者結(jié)合應(yīng)用,但是手術(shù)風(fēng)險大,費用高,并且遠期的復(fù)發(fā)率和再手術(shù)率仍然較高。伴隨著影像學(xué)技術(shù)及醫(yī)療設(shè)備條件的進步,AD疾病檢出率呈上升趨勢,對于AD的發(fā)生及發(fā)病機制的研究也在不斷深入。AD生成機制與遺傳學(xué)密切相關(guān)。AD相關(guān)易感基因是目前AD遺傳學(xué)研究熱點,從基因角度分析與AD相關(guān)的易感基因很有意義。

伴隨著人類基因組測序計劃完成和高通量測序技術(shù)的發(fā)展,醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的科研工作者對人類基因組有了更深入的認(rèn)識,對疾病相關(guān)遺傳變異、相關(guān)基因的功能及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的認(rèn)識也逐漸加深,高通量測序得到廣泛應(yīng)用。全外顯子組測序(Whole Exome Sequencing,WES)技術(shù)是利用外顯子捕獲試劑盒捕捉整個外顯子區(qū)域DNA,然后進行高通量測序,是目前基因組學(xué)研究中非常成熟的一部分。近兩年來,采用WES技術(shù)研究復(fù)雜疾病的文獻報道開始出現(xiàn),展現(xiàn)出該技術(shù)的巨大優(yōu)勢。Ziganshin BA等學(xué)者對102例胸主動脈瘤和AD患者進行WES分析,發(fā)現(xiàn)21.6%患者存在1個或多個其它基因的突變,3.9%患者存在FBN1、COL5A1、MYLK、FLNA基因的有害突變。Janice L.Farlow等對45位顱內(nèi)動脈瘤患者進行了WES,發(fā)現(xiàn)68個基因存在變異,TMEM132B基因的表達在患者和對照者中顯著不同(44VS 16)。表明在常見復(fù)雜疾病中可通過高通量測序鑒別罕見變異。并且,有越來越多的證據(jù)表明稀有變異對常見疾病易患性有中到強度的效應(yīng)影響,可解釋很大部分的遺傳缺失。罕見突變(MAF1%或5%)的局限性,而且費用、時間成本均較高。全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome wide associationstudies,GWAS)只能識別常見變異(common variants,CV:MAF>5%),忽略了某些未知的與AD發(fā)病相關(guān)的功能候選基因。WES相較于全基因組測序(Whole Genome Sequencing,WGS)、GWAS具有對基因組編碼區(qū)域的高深度測序,除大片段的缺失重復(fù)及SNP外,還能發(fā)現(xiàn)低頻突變、罕見突變,識別范圍更廣,具有低成本、高效率的優(yōu)勢,是尋找疾病易感基因或位點特別是發(fā)現(xiàn)新易感基因或位點最常用的方法之一,可彌補GWAS不能篩選未知候選基因的缺陷。

AD血管風(fēng)險高,不容易早期發(fā)現(xiàn),基于已知致病基因的遺傳學(xué)診斷陽性率有限,難于做早期風(fēng)險評估,亟待發(fā)現(xiàn)新的分子標(biāo)志物。

發(fā)明內(nèi)容

為了解決上述問題,本發(fā)明的目的在于提供一種基于全外顯子測序技術(shù)篩選與主動脈夾層疾病相關(guān)的SNP位點,所述SNP位點包括以下主動脈夾層易感性SNP位點:CLIP3:NM_001199570:exon1:c.32CT:p.P11L。

進一步地,本發(fā)明提供了所述的SNP位點在制備檢測主動脈夾層疾病的試劑中的應(yīng)用。

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