[發(fā)明專利]ABCB1、CYP3A5基因檢測引物組、試劑盒及檢測方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201810059600.3 | 申請(qǐng)日: | 2018-01-22 |
| 公開(公告)號(hào): | CN109439738A | 公開(公告)日: | 2019-03-08 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 盛司潼;徐云;符兆威 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 武漢康昕瑞基因健康科技有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6869 | 分類號(hào): | C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京遠(yuǎn)智匯知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11659 | 代理人: | 張海英 |
| 地址: | 430040 湖北省武漢市東湖新技術(shù)*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 測位 引物組 檢測 特異性擴(kuò)增 核酸片段 檢測引物 位點(diǎn) 分子生物學(xué)領(lǐng)域 基因檢測試劑盒 基因測序技術(shù) 基因工程 基因檢測 假陽性率 突變檢測 高通量 基因型 靈敏度 試劑盒 通量 引物 | ||
本發(fā)明涉及基因工程及分子生物學(xué)領(lǐng)域,提供一種ABCB1、CYP3A5基因檢測引物組,用于對(duì)含待測位點(diǎn)的核酸片段進(jìn)行特異性擴(kuò)增,所述待測位點(diǎn)包括ABCB1基因上的rs1045642位點(diǎn)和CYP3A5基因上的rs776746位點(diǎn),所述引物組包括rs1045642引物組、rs776746引物。本發(fā)明還提供了一種基因檢測試劑盒及檢測方法。本發(fā)明的基因檢測引物組能夠?qū)鲜龃郎y位點(diǎn)的核酸片段進(jìn)行特異性擴(kuò)增,使得對(duì)ABCB1、CYP3A5基因突變檢測靈敏度高、假陽性率低;本發(fā)明采用第二代高通量基因測序技術(shù)對(duì)待測位點(diǎn)的基因型進(jìn)行檢測,使得檢測周期短,通量高。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及基因工程及分子生物學(xué)領(lǐng)域,更具體地說,涉及一種ABCB1、CYP3A5基因檢測引物組、試劑盒及檢測方法。
背景技術(shù)
紫杉醇是一種三環(huán)二萜類化合物,具有獨(dú)特的抗腫瘤機(jī)制,其廣泛的抗癌譜和確切的臨床療效已得到人們的重視。后經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)紫杉醇是一種微管的特異性穩(wěn)定劑,可促進(jìn)微管的裝配和保持微管穩(wěn)定。當(dāng)細(xì)胞與紫杉醇接觸后,會(huì)在細(xì)胞內(nèi)積累大量的微管,而這些微管的積累將干擾細(xì)胞的各種正常功能,特別是使細(xì)胞分裂停止于有絲分裂期,阻斷了細(xì)胞的正常分裂。基于上述機(jī)制,紫杉醇是目前所研究報(bào)道的惟一一種能控制癌細(xì)胞生長的植物藥。學(xué)者們推測紫杉醇的不良反應(yīng)的產(chǎn)生主要是因?yàn)樽仙即甲饔糜诩?xì)胞內(nèi)微管系統(tǒng),而該系統(tǒng)遍布于體內(nèi)所有的細(xì)胞,故紫杉醇的作用未能特異地靶向癌細(xì)胞,而是普遍作用于體內(nèi)各種細(xì)胞。
研究表明人ABCB1基因通過ATP水解提供動(dòng)力將底物外排至細(xì)胞外,可將腫瘤藥物逆濃度梯度從胞漿內(nèi)泵至胞漿外,從而降低化療藥物誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡并導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞耐藥。有研究認(rèn)為,人CYP3A5基因突變是導(dǎo)致其表達(dá)水平發(fā)生改變的主要調(diào)控方式,同時(shí)也能影響其代謝酶的活性,最終表現(xiàn)為代謝底物的能力和速率發(fā)生不同程度的改變,是導(dǎo)致臨床用藥出現(xiàn)個(gè)人、種族間差異最重要的原因。
已發(fā)現(xiàn)的ABCB1基因多態(tài)性如ABCB1 C3435T(rs1045642)突變導(dǎo)致細(xì)胞外泵能力降低,表現(xiàn)在腫瘤細(xì)胞中,則使療效更好。CYP3A5*3(rs776746)基因型是CYP3A5基因的第3內(nèi)含子的6986A>G突變產(chǎn)生的,CYP3A5的表達(dá)水平及其酶的活性密切相關(guān)。CYP3A5*3基因型導(dǎo)致mRNA的剪接發(fā)生改變,使翻譯提早終止,蛋白質(zhì)截短,導(dǎo)致CYP3A5酶活性降低甚至消失,是人群中CYP3A5基因最主要的基因多態(tài)性。
通過對(duì)患者的兩種基因進(jìn)行檢測,得到特定位點(diǎn)的基因型,以基因檢測結(jié)果作為中間結(jié)果的信息的方法,不屬于疾病的診斷方法;以基因型的檢測結(jié)果來確定藥物的選擇,就可以實(shí)現(xiàn)個(gè)體化用藥,避免對(duì)免疫抑制劑不良反應(yīng)。
目前對(duì)基因突變和基因多態(tài)性的檢測,常見有直接測序法、基因芯片雜交法、Taqman熒光探針法、等位基因特異性擴(kuò)增法(Amplification Refractory MutationSystem Real Time PCR,ARMS-RT PCR)、等位基因特異性擴(kuò)增法(AmplificationRefractory Mutation System Real Time PCR,ARMS-RT PCR)等。上述方法靈敏度低、假陽性率高、耗時(shí)較長,通量小。
因此,需要一種新的檢測ABCB1、CYP3A5基因突變的試劑盒及檢測方法,使得對(duì)ABCB1、CYP3A5基因突變的靈敏度高,假陽性率低,且檢測周期短。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種ABCB1、CYP3A5基因檢測引物組、試劑盒及檢測方法,旨在解決現(xiàn)有技術(shù)中ABCB1、CYP3A5基因檢測靈敏度低、假陽性率高、周期長,通量小的技術(shù)問題。
本發(fā)明提供了一種ABCB1、CYP3A5基因檢測引物組,用于對(duì)含待測位點(diǎn)的核酸片段進(jìn)行特異性擴(kuò)增,所述待測位點(diǎn)包括ABCB1基因上的rs1045642位點(diǎn)和CYP3A5基因上的rs776746位點(diǎn),所述引物組包括rs1045642引物組、rs776746引物組;
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