[發(fā)明專利]具有通用元件的基于熒光團(tuán)的寡核苷酸探針在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201480045830.4 | 申請(qǐng)日: | 2014-06-18 |
| 公開(公告)號(hào): | CN105555969A | 公開(公告)日: | 2016-05-04 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | D·弗倫奇;保羅·德貝納姆;麗貝卡·霍華德;T·布朗;J·理查德森 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | LGC有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 隆天知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 72003 | 代理人: | 王芝艷;吳小瑛 |
| 地址: | 英國米德*** | 國省代碼: | 英國;GB |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 具有 通用 元件 基于 熒光 寡核苷酸 探針 | ||
1.一種檢測(cè)目的樣品中靶多核苷酸的存在和/或靶多核苷酸內(nèi)部序列變異的存在的方 法,包括步驟:
(i)提供包含兩個(gè)獨(dú)立的配偶體寡核苷酸組分的探針,所述兩個(gè)獨(dú)立的配偶體寡核苷 酸組分包括:
a)具有第一和第二區(qū)段的第一寡核苷酸,其中第一區(qū)段包含用至少一種目視可檢測(cè)標(biāo) 記物標(biāo)記并且不能夠與所述靶多核苷酸的核苷酸序列雜交的核苷酸序列;并且其中第二區(qū) 段包含能夠與所述靶多核苷酸的一部分序列雜交的核苷酸序列,第一寡核苷酸的所述第二 區(qū)段具有在25℃和50℃之間的解鏈溫度(Tm);和
b)具有第一和第二區(qū)段的第二寡核苷酸,其中第一區(qū)段包含能夠與第一寡核苷酸的第 一區(qū)段的核苷酸序列雜交的核苷酸序列;并且第二區(qū)段包含能夠與靶多核苷酸的核苷酸序 列雜交的核苷酸序列,所述靶多核苷酸的核苷酸序列毗鄰于第一寡核苷酸的第二區(qū)段能夠 與之雜交的核苷酸序列,所述第二寡核苷酸的第二區(qū)段具有在40℃和70℃之間的解鏈溫度 (Tm);
(ii)使目的樣品暴露于(i)的探針,從而在靶多核苷酸存在下,三重雜交事件可以發(fā) 生,所述三重雜交事件包括(a)第一寡核苷酸的第一區(qū)段與第二寡核苷酸的第一區(qū)段雜交; 和(b)第一寡核苷酸的第二區(qū)段和第二寡核苷酸的第二區(qū)段均與靶多核苷酸雜交;
(iii)檢測(cè)目視可檢測(cè)標(biāo)記物的變化,其中目視可檢測(cè)標(biāo)記物的變化表示存在靶多核 苷酸和/或靶多核苷酸內(nèi)部的序列變異;并且
(iv)使用解鏈曲線分析或復(fù)性曲線分析,分析目視可檢測(cè)標(biāo)記物的變化。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中第一寡核苷酸用至少一種目視可檢測(cè)標(biāo)記物內(nèi)部 標(biāo)記。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的方法,其中第一寡核苷酸具有15個(gè)至40個(gè)核苷酸殘基之間 或20至30個(gè)核苷酸殘基之間的長度;和/或第二寡核苷酸具有20個(gè)至50個(gè)核苷酸殘基之間 或25個(gè)至40個(gè)核苷酸殘基之間的長度。
4.根據(jù)前述任一項(xiàng)權(quán)利要求所述的方法,其中第一和第二寡核苷酸的第二區(qū)段與之雜 交的靶多核苷酸的核苷酸序列具有15個(gè)至50個(gè)核苷酸之間或25個(gè)至40個(gè)核苷酸之間的長 度。
5.根據(jù)前述任一項(xiàng)權(quán)利要求所述的方法,其中靶多核苷酸和/或靶多核苷酸內(nèi)部的序 列變異僅在三重雜交事件已經(jīng)發(fā)生后是可檢測(cè)的。
6.根據(jù)前述任一項(xiàng)權(quán)利要求所述的方法,其中第一寡核苷酸的第二區(qū)段和第二寡核苷 酸的第二區(qū)段與靶多核苷酸的連續(xù)序列雜交。
7.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的方法,其中第一寡核苷酸的第二區(qū)段和第二寡核 苷酸的第二區(qū)段與靶多核苷酸的非連續(xù)序列雜交。
8.根據(jù)前述任一項(xiàng)權(quán)利要求所述的方法,其中第一寡核苷酸的第二區(qū)段的解鏈溫度 (Tm)在30℃和40℃之間;并且第二寡核苷酸的第二區(qū)段的Tm在50℃和60℃之間。
9.根據(jù)前述任一項(xiàng)權(quán)利要求的方法,其中第二寡核苷酸的第二區(qū)段的靶多核苷酸的解 鏈溫度(Tm)大于第一寡核苷酸的第二區(qū)段的靶多核苷酸的Tm,以確保鑒定錯(cuò)配序列。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法,其中第二寡核苷酸的第二區(qū)段的Tm比第一寡核苷酸的 第二區(qū)段高10℃。
11.根據(jù)權(quán)利要求1至8中任一項(xiàng)所述的方法,其中第二寡核苷酸的第二區(qū)段的靶多核 苷酸的Tm與第一寡核苷酸的第二區(qū)段的靶多核苷酸的Tm相同。
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