[發(fā)明專利]四種果樹食心蟲分子鑒定引物及使用方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410033127.3 | 申請日: | 2014-01-22 |
| 公開(公告)號: | CN103882116A | 公開(公告)日: | 2014-06-25 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 陳茂華;李玉婷;鄭燕;王康;錢路;吳偉 | 申請(專利權(quán))人: | 西北農(nóng)林科技大學(xué);江蘇出入境檢驗檢疫局動植物與食品檢測中心;新源縣農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣站 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 712100 陜*** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 果樹 食心蟲 分子 鑒定 引物 使用方法 | ||
1.四種果樹食心蟲分子鑒定引物,分子鑒定引物的序列為:
COI基因上游引物C1F:5’-TGGTCACCCAGAAGTTTA-3’
COI基因下游引物C1R:5’-AAGAGTAACATCAATAGAAG-3’
COII基因上游引物C2F:5’-ATTGCTTTACCATCTCTTCG-3’
COII基因下游引物C2R:5’-AAACTATGATTTGCTCCACA-3’。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的四種果樹食心蟲分子鑒定引物,其使用方法,特征在于:包括如下步驟:
一、提取待鑒定樣品的基因組DNA;
二、以步驟一所得基因組DNA為模板,利用上述兩對引物對基因組DNA中的線粒體COI和COII基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
三、取適量步驟二的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用瓊脂糖電泳檢測結(jié)果,經(jīng)溴化乙錠染色后于紫外燈下觀察,兩對引物擴(kuò)增的片段大小分別為316bp和350bp,將得到的特異性產(chǎn)物測序,利用Chromas2.4軟件讀取測序結(jié)果,觀察峰圖并進(jìn)行校對,通過軟件CLUSTALX1.83將所得序列進(jìn)行多序列同源比對,并利用p-distance計算各食心蟲間的遺傳距離;結(jié)果表明與其中一種食心蟲中的序列相似度達(dá)到99%以上即可認(rèn)為是該食心蟲,即通過序列差異來區(qū)分四種果樹食心蟲。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的四種果樹食心蟲分子鑒定引物的使用方法,其特征在于:所述步驟二中PCR反應(yīng)體系和條件為:PCR反應(yīng)體系為25μL,含2×PCR?Master?mix12.5μL,正/反向引物各3μL,DNA模板2μL,含20~50ng?DNA,ddH2O補足25μL;PCR反應(yīng)條件為:94℃下預(yù)變性2min;而后35個循環(huán),每個循環(huán)包括94℃變性30s,52℃退火30s,72℃延伸30s;最后72℃延伸5min。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的四種果樹食心蟲分子鑒定引物的使用方法,其特征在于:所述步驟三中使用1%瓊脂糖電泳檢測。
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的四種果樹食心蟲分子鑒定引物的使用方法,其特征在于:所述步驟一中,提取DNA的具體步驟如下:將樣本置于一無菌的1.5ml離心管中,充分研磨后加入180μl常用裂解液(含有100mmol?pH8.0Tris-HC1、25mmol?pH8.0EDTA、500mmol?NaC1,1%SDS)和20μl蛋白酶K,55℃孵育12-15小時至完全裂解;加入20μl?RNaseA,室溫孵育2分鐘;12000rpm離心5分鐘,轉(zhuǎn)移上清于一無菌離心管中;加入10μl10%SDS于裂解液中,立即漩渦5秒;加入700μl苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),立即漩渦5秒,12000rpm離心10分鐘;取上清,加入等體積的氯仿:異戊醇(24:1),12000rpm離心5min;取上清,加入等體積無水乙醇于裂解物,漩渦混合5秒;將全部的溶液加入吸附柱中,12000rpm離心30秒,棄去流出液;吸附柱中加入500μl75%乙醇,12000rpm離心30秒,棄去流出液,重復(fù)一次;12000rpm離心2分鐘,徹底去除殘留的乙醇;將吸附柱置于一干凈的離心管中,在柱的中央加入200μl預(yù)熱60℃的TE溶液,室溫靜置1分鐘,12000rpm離心1分鐘,洗脫DNA;重復(fù)洗脫DNA得到更多的DNA,洗脫出的DNA于-20℃保存。
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