[發明專利]一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法有效
| 申請號: | 201210203604.7 | 申請日: | 2012-06-20 |
| 公開(公告)號: | CN102750458A | 公開(公告)日: | 2012-10-24 |
| 發明(設計)人: | 劉正理;張梅申;張永信;張婷;夏雪巖;程汝宏;師志剛;李偉 | 申請(專利權)人: | 河北省農林科學院谷子研究所 |
| 主分類號: | G06F19/14 | 分類號: | G06F19/14;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 石家莊匯科專利商標事務所 13115 | 代理人: | 王琪 |
| 地址: | 050035 河北省石家莊*** | 國省代碼: | 河北;13 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 谷子 育種 材料 細胞質 類型 劃分 方法 | ||
1.一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法,其特征在于包括如下步驟:(1)細胞質來源進化樹的構建;(2)母本衍生進化圖的構建;(3)特定遺傳相似系數的確定及細胞質來源的分子聚類;(4)谷子育種材料細胞質類型的確定。
2.根據權利要求1一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法,其特征在于步驟(1)所述的細胞質來源進化樹的構建包括如下步驟:
①葉片組織的培養與獲?。簩⒐茸佑N材料的種子種于育苗盤中獲得谷子幼苗,于4葉期分別剪取育種材料的葉片組織;
②全基因組DNA的提?。翰捎肅TAB法提取步驟①中葉片組織的全基因組DNA;
③PCR擴增:采用20μl反應體系,利用線粒體特異引物對步驟②提取的基因組DNA進行37個反應循環PCR擴增;
④多態性檢測:利用凝膠電泳法對步驟③中線粒體的PCR擴增產物進行多態性檢測;
⑤細胞質來源進化樹的生成:對步驟④中電泳圖譜上清晰且可重復出現的條帶記為“1”,同一位置沒有出現的帶記為“0”,生成由“1”和“0”組成的原始矩陣,用NTSYS-pc2.1軟件進行數據分析,用SAHN程序中的UPGMA方法進行聚類分析,生成細胞質來源的進化樹。
3.根據權利要求1一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法,其特征在于步驟(2)所述的母本衍生進化圖的構建為:利用系譜追蹤法將谷子育種材料按權利要求2中所述的細胞質來源進化樹的構建中所構建進化樹的排列順序進行縱向排列,通過逐代向上追蹤育種材料的母本,直到追蹤到農家品種為止,依據系譜將同一母本衍生的育種材料按照衍生關系逐步連接起來,形成母本衍生進化圖。
4.根據權利要求1的一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法,其特征在于步驟(3)所述的特定遺傳相似系數的確定及細胞質來源的分子聚類為:將權利要求3中所述的母本衍生進化圖的構建中所構建的谷子育種材料的母本衍生進化圖與權利要求2中所述的細胞質來源進化樹的構建中所構建的進化樹相結合,并進行比較分析,確定基本能將同一母本衍生系統聚為一個分枝的特定遺傳相似系數,在該遺傳相似系數下對權利要求2中所述的細胞質來源進化樹的構建中所構建的進化樹進行縱切,將谷子育種材料進行胞質來源的分子聚類,分子聚類中每個分枝代表一個胞質類群。
5.根據權利要求1一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法,其特征在于步驟(4)所述的谷子育種材料細胞質類型的確定為:將權利要求4中所述的特定遺傳相似系數的確定及細胞質來源的分子聚類中所形成的分子聚類圖與權利要求3中所述的母本衍生進化圖的構建中所構建的谷子育種材料的母本衍生進化圖相結合,將胞質來源分子聚類圖中的每個分枝與對應的母本衍生系統逐一進行對比,確定每個類群材料的細胞質類型,完成對谷子育種材料細胞質類型進行劃分。
6.根據權利要求2一種谷子育種材料細胞質類型的劃分方法,其特征在于步驟(1)所述的細胞質來源進化樹的構建中步驟①中所述的谷子育種材料為:延谷12、長高117A、大同29紫、冀谷26、冀谷30、壩谷214、安9217、保182、冀谷12、石06-766、延谷13、冀谷20、冀谷22、谷65、冀谷21、大同27、赤谷10、承谷12、大同30、豫谷6、大同14、鄭9188、大同28、鐵8240、錦谷12、錦谷14、朝438、公谷68、鐵487、鐵谷6、復532、晉汾1、滄156、濟谷13、長高229A、S80、冀谷29、公谷70、石206065、大同29綠、安2491、興谷88、晉15、晉汾3、滄344、Y61、石02399、C138、C208、朝谷12、K523、L70、鐵大粒黃、K359、朝谷13、谷83、衡968、濟9403、冀谷27、濟9409、魯谷10、濟谷12、濟谷11、谷6、石02521、石98700、石207382、石207393、石02530、石207286、安4852、谷3、冀谷25、石207191、長高146A、石207226、石206058、公谷65、C164、203184早、安2367、石202242、谷57、冀谷24、谷豐2號、石06-439、谷38、小香米、冀谷19、K1130、壩谷214-2、谷11、K1011、長農36、冀谷28、長農35、晉谷35、太選5號、太選2號、晉谷21、谷95、晉谷29、朝谷14、K660、美國大頭、谷10、K546、朝綠-1、晉谷16、石98622和石97672共111份。
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