[發明專利]玉米MuDR轉座子插入側翼序列的分離方法在審
| 申請號: | 201210201905.6 | 申請日: | 2012-06-19 |
| 公開(公告)號: | CN102876667A | 公開(公告)日: | 2013-01-16 |
| 發明(設計)人: | 陶勇生;張祖新;王婷婷;楊偉峰 | 申請(專利權)人: | 陶勇生 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12N15/10 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 100041 北京市*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 玉米 mudr 座子 插入 側翼 序列 分離 方法 | ||
1.一種玉米MuDR轉座子插入側翼序列的分離方法,其特征在于:包括如下步驟:?
第一、MuDR誘變材料的制取:用雜交方式構建誘變群體,并篩選出突變體材料;
第二、突變體材料的DNA提取;
第三、巢式引物和簡并引物設計:在MuDR轉座子TIR序列的保守序列設計巢式引物TIR9-1和TIR9-2序列,所述TIR9-1序列為:ATAGAAGCCAACGCCATGGCCTCCATTTCGTC,所述TIR9-2序列為:GGCCTCCATTTCGTCGAATCCCTT;簡并引物是根據物種共享的蛋白質的保守氨基酸序列設計;
第四、進行MuTAIL-PCR反應,并在反應中添加甘油和二甲基亞砜;
第五、MuDR轉座子插入側翼序列的真實性檢測。
2.?根據權利要求1所述的分離方法,其特征在于:所述巢式引物TIR9-1和TIR9-2的序列,是根據對突變體材料DNA的測序和MuDR特異性引物擴增的結果,獲得MuDR的TIR序列;然后,將MuDR的TIR序列與Mutator轉座子家族其他成員的TIR進行比對,獲得了MuDR-TIR特異性序列區域,并以此為基礎設計了巢式引物TIR9-1和TIR9-2。
3.?根據權利要求2所述的分離方法,其特征在于:所述分離方法還包括對MuTAIL-PCR反應的產物使用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
4.根據權利要求3所述的分離方法,其特征在于:所述MuTAIL-PCR反應包括第一輪反應和第二輪反應,所述第一輪反應中包括利用巢式引物TIR9-2和簡并引物進行預擴增,并進行高特異性循環。
5.根據權利要求4所述的分離方法,其特征在于:所述第二輪反應中包括利用巢式引物TIR9-2和簡并引物進行擴增,并進行超級循環。
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