[發明專利]梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒及其制備有效
| 申請號: | 201110232497.6 | 申請日: | 2011-08-12 |
| 公開(公告)號: | CN102251052A | 公開(公告)日: | 2011-11-23 |
| 發明(設計)人: | 楊天賜;張忠英;林麗蓉;劉莉莉;方贊熙;黃松潔;張長弓 | 申請(專利權)人: | 廈門大學附屬中山醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12R1/01 |
| 代理公司: | 廈門南強之路專利事務所 35200 | 代理人: | 馬應森 |
| 地址: | 361004 福建省廈*** | 國省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 梅毒 螺旋體 實時 熒光 定量 pcr 檢測 試劑盒 及其 制備 | ||
1.梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒,其特征在于設有DNA提取試劑瓶、耐熱DNA聚合酶瓶、PCR反應液瓶、標準品瓶、質控品瓶和包裝盒;所述DNA提取試劑瓶設有蛋白酶K瓶、裂解液瓶、無水乙醇瓶、抑制物去除液瓶、第1清洗緩沖液瓶、洗脫液瓶、第2清洗緩沖液瓶和含收集管的離心柱;所述標準品瓶設有6個含5個靶基因的標準品質粒瓶,所述5個靶基因為polA基因、TPN47基因、tmpA基因、TpF-1基因和bmp基因5個梅毒高特異性基因;所述質控品瓶設有陰性質控品瓶和陽性質控品瓶;所述6個含5個靶基因的標準品質粒瓶、PCR反應液瓶、含收集管的離心柱、陰性質控品瓶、陽性質控品瓶、Tag酶瓶、蛋白酶K瓶、裂解液瓶、無水乙醇瓶、抑制物去除液瓶、第1清洗緩沖液瓶、洗脫液瓶和第2清洗緩沖液均布在外包裝盒內。
2.如權利要求1所述的梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒,其特征在于所述陰性質控品為不含梅毒螺旋體DNA的樣品,陽性質控品為含梅毒螺旋體DNA的樣品。
3.如權利要求1所述的梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒,其特征在于所述6個含5個靶基因的標準品質粒的濃度分別為1.0×102copies/mL、1.0×103copies/mL、1.0×104copies/mL、1.0×105copies/mL、1.0×106copies/mL和1.0×107copies/mL,共6個濃度。
4.如權利要求1所述的梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒,其特征在于所述PCR反應液的成份含有PCR緩沖液、MgCl2、dNTPs和5對引物探針組成的混合物。
5.如權利要求1所述的梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒,其特征在于所述耐熱DNA聚合酶具有3′→5′DNA聚合酶活性、5′→3′DNA外切核酸酶活性和可耐受高溫的聚合酶;所述耐熱DNA聚合酶是半衰期>45min的高溫聚合酶。
6.如權利要求1所述的梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒的制備方法,其特征在于包括以下步驟:
1)靶基因篩選,具體方法如下:
從基因庫(GENBANK)中篩選梅毒螺旋體靶基因,包括polA基因、TPN47基因、tmpA基因、TpF-1基因和bmp基因5個梅毒特異性基因,5對梅毒高特異性基因探針和引物的設計采用PCR引物探針設計軟件primer?premier?5.0、Oligo?6.0、TM?Utility?vl.3、Clustal?X等設計軟件輔助完成,然后通過Basic?Local?Alignment?Search?Tool(BLAST)進行同源性比對以保證其特異性,合成的引物和探針用TE(10mM?Tri-HCl,pH5.0,0.1mM?TA)溶解,使用ND-1000UV-VIS波長紫外/可見光掃描分光光度計進行濃度測定后,保存;
2)多靶基因標準品質粒的構建,具體方法如下:
以硅膠膜-離心柱法提取梅毒螺旋體Nichols株DNA作為模板,采用步驟1)中的5個靶基因的引物,進行PCR擴增,具體過程如下:將擴增產物經過回收及純化后,在微量離心管中配制DNA溶液,后加入5μL等量的Solution?I,16℃反應30min,與pMD18-T載體連接將連接產物轉化至DH5α中,冰中放置30min,42℃加熱45s后,再在冰中放置1min,加入LB培養基,37℃震蕩培養60min后,在含有X-Gal、IPTG、Amp的LB瓊脂平板培養基上培養,形成單菌落,挑選白色菌落,進行增殖培養,提取質粒并對其進行PCR,Xab?I和Sal?I雙酶切及測序鑒定后,將構建好的質粒進行單酶切線性化處理,再用紫外分光光度計定量并-20℃保存作為Real-time?PCR的標準品;
3)多靶基因檢測試劑標準曲線制作,其具體方法如下:
包含靶基因的陽性克隆大腸桿菌在含Amp?LB肉湯增菌,提取質粒,取10μL質粒用雙蒸水稀釋100倍,260nm,280nm比色,純度=A260/A280,濃度=A260×50×2×100×10-6×6.02×1023/(2806×324.5×2)copies/mL,根據質粒濃度,進行梯度稀釋,以每個濃度標準品作模板進行熒光定量反應,確定線性范圍;
4)制備PCR反應液,其具體方法如下:
采用PCR緩沖液、MgCl2、dNTPs、5對引物探針的混合物共同組成PCR反應液;
5)制備耐熱DNA聚合酶,其具體方法如下:
大腸桿菌用異丙基硫代-β-D半乳糖苷進行誘導表達,誘導后的菌懸液菌懸液100ml經5000r/min,4℃離心5min,以10ml緩沖液I重懸菌液,4℃,5000r/min,離心5min,細菌沉淀再懸于5ml緩沖液I中,加入溶菌酶使濃度達5mg/ml,37℃水浴20min;加入5ml緩沖液II,75℃水浴45min,4℃,15000r/min離心10min;上清加入硫酸銨使達30%,4℃,1500r/min離心10min,沉淀溶于1ml緩沖液III中,并對緩沖液III在4℃條件下透析,每6h換液1次共4次,離心除去不溶物后,-20℃凍存;
6)建立樣品處理方法,其具體方法如下:
使用梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑檢測梅毒螺旋體的樣本,采用硅膠膜-離心柱法提取模板DNA;
7)制備質控品,其具體方法如下:
制備陰性質控品:選擇經過臨床確認為陰性的臨床標本;
制備陽性質控品:選擇經過臨床確認為陽性的臨床標本經稀釋獲得陽性質控品;
8)制備梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒,將DNA提取試劑、耐熱DNA聚合酶、PCR反應液、標準品和質控品共同組成梅毒螺旋體實時熒光定量PCR多靶檢測試劑盒。
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