技術領域

本發明屬于遺傳育種學和水產養殖學領域，更具體地，本發明涉及一種與甌江彩鯉粉花體色相連鎖的DNA分子、引物及一種檢測甌江彩鯉粉花體色的方法。?

背景技術

甌江彩鯉，是浙江省甌江流域的地方性養殖對象，至今已有1200余年的養殖歷史。甌江彩鯉不僅生長迅速、營養豐富，有極為優良的食用性能，而且體色豐富，色彩艷麗，有紅色、白色和花色等多種多樣的體色，可與著名的日本錦鯉相媲美，作為觀賞魚類開發也具有巨大的發展潛力。在2000年對甌江彩鯉進行系統開發利用以前，有五種基本體色：一是“全紅”(全身體表均為紅色)，二是“大花”(即全紅體表鑲嵌大塊黑色斑紋)、三是“麻花”(即全紅體表散布黑色小斑點)、四是“粉玉”(即全身體表呈粉白色)，五是“粉花”(即粉白色體表鑲嵌大塊黑色斑紋)。程起群等在2001年第28卷第2期的《水產科技情報》上報道了不同體色甌江彩鯉的生長率和成活存在顯著差異。王成輝等在2004年第13卷第2期的《上海水產大學學報》上也報道了不同體色甌江彩鯉在不同的飼養環境中存在顯著的生長差異，表現出較強的遺傳環境互作。上述研究表明：不同體色的甌江彩鯉存在生長率和成活率上的差異，即體色與生長性狀存在一定的相關性。?

為進一步研究和探索甌江彩鯉體色與生長性能的相關和連鎖關系，一直希望找到不同體色的特異性分子標記，以期為甌江彩鯉的分子標記輔助育種提供依據，實現魚類育種從傳統育種向現代分子標記育種的跨越。?

發明內容

本發明所要解決的技術問題是提供一種與甌江彩鯉粉花體色相連鎖的DNA分子、引物以及檢測甌江彩鯉粉花體色的方法，來為甌江彩鯉的分子標記輔助育種提供依據。?

本發明所要解決的技術問題通過如下技術方案實現：?

一種用于檢測甌江彩鯉粉花體色的DNA分子，所述的DNA分子具有：SEQ?ID?NO：?1中所示的核苷酸序列；?

一種用于檢測(尤其是早期檢測，即體色尚未穩定時的檢測)甌江彩鯉粉花體色的引物，所述引物的長度為20個核苷酸，并且所述的引物可擴增出具有SEQ?ID?NO：1中所示的核苷酸序列的DNA分子：核苷酸序列；?

所述引物還可選自：具有SEQ?ID?NO：2或SEQ?ID?NO：3與SEQ?ID?NO：4所示核苷酸序列的引物；?

一種早期檢測甌江彩鯉粉花體色的方法，包括：從待測魚群隨機選取10-100尾魚，優選20-50尾魚，更優選50-50尾魚；檢測它們的基因組DNA中是否存在具有SEQ?ID?NO：1中所示核苷酸序列的DNA分子，若存在則是甌江彩鯉粉花群體。?

所述方法中，可利用具有SEQ?ID?NO：2或SEQ?ID?NO：3與SEQ?ID?NO：4所示核苷酸序列的引物檢測待測魚的基因組DNA。?

發明人應用隨機擴增多態性DNA(Random?Amplified?Polymorphic?DNA，RAPD)技術對前面所述五種體色甌江彩鯉的觀賞型選育配套系F5進行全基因組掃描，發現了一條與“粉花”體色相關的特異性條帶，并將此條帶成功的轉為SCAR(Sequence?CharacterizedAmplified?Region)標記，用于對“粉花”體色甌江彩鯉的特異性分子標記與檢測。?

本發明人經過近一年試驗，首次揭示與“粉花”體色相連鎖的特異性分子標記，并可檢測“粉花”體色甌江彩鯉，所述分子標記存在于“粉花”體色甌江彩鯉的基因組DNA中，而在其它四體色甌江彩鯉的基因組DNA中不存在或者存在幾率顯著降低，因而所述分子標記可良好地反映“粉花”體色甌江彩鯉的基因組特點，并應用于檢測“粉花”體色甌江彩鯉，以及應用后續的甌江彩鯉分子標記輔助育種。本發明還揭示了基于所述分子標記設計的引物和試劑盒。?

基本原理?

本發明的最主要理論基礎是基于不同體色甌江彩鯉之間基因組序列的多態性，以及隨機擴增多態性DNA(Random?Amplified?Polymorphic?DNA，RAPD)、序列特異擴增區域(Sequence?Characterized?Amplified?Regions，SCAR)分析方法。?