DNA芯片是隨著“人類基因組計劃”研究的發展應運而生的，它是近幾年在高科技領域內出現的最具時代特征的重大科技進展之一。它是物理學、微電子學、化學與生命科學交叉綜合的高科技。DNA芯片集成的不是電子元器件，而是利用或借助微電子芯片技術的集約化和平行處理原理，將大量具有生物學意義的特定序列的DNA片段有序地固化在硅襯底或玻璃上，利用DNA芯片，可快速、高效地獲取大量的生命信息(包括基因識別、基因突變、基因測序和基因表達活性等)。它將對生命科學研究、醫學診斷、新藥篩選和新材料研究具有革命性的推動作用。也將對提高我國人口素質、健康水平、農業發展和環境保護等國家目標的實現作出巨大貢獻。DNA芯片研究不僅具有重大的基礎研究價值，而且具有巨大的商業化前景。

乙肝病毒是嚴重威脅我國人民身體健康的病原體微生物之一。我國約有1.2億人口攜帶乙肝病毒，5歲以下幼兒感染乙肝病毒后轉變為慢性乙肝患者可達30％，其中5-10％慢性乙肝患者將有可能發展成為肝硬化或肝癌。近十年來，通過接種乙肝疫苗在降低乙肝病毒感染率方面發揮了重要作用，但對乙肝的治療和診斷方面進展不大。目前臨床上診斷HBV感染的手段主要為檢測HBV基因產物(HBsAg、HBeAg)及其抗體(Anti-HBs、Anti-HBc)的血清學方法及HBV?DNA的斑點雜交和PCR法。近十年研究發現，HBV基因的多個位點如S、P及C基因區等易發生變異可導致HBV基因的多態性，給乙型肝炎的診斷、治療和預防提出了新的問題，如漏檢、疫苗免疫失敗、耐藥及臨床病程變化等。因此，提供一種可具體反映HBV致病特征、耐藥性、免疫逃逸等基因突變的基因診斷方法實為臨床乙肝防治所必需。近年興起的DNA芯片技術提供了檢測乙肝病毒基因多態性的可能性，有可能成為協助臨床診斷、治療乙肝患者的有效手段。目前，國內研制的肝炎病毒檢測芯片將乙肝病毒和丙肝病毒的保守序列固定在玻片上，只能檢測出乙肝病毒或丙肝病毒，而不能檢測出它們的分型。而本發明提供的乙肝病毒基因多態性檢測芯片不僅可以檢測是否有乙肝病毒和乙肝病毒的分型，而且可以獲得發生突變的位點，以及有關的耐藥性信息等，也可檢測出丙肝分型，與傳統的檢測方法(血清學檢測等)相比，具有速度快、正確率高、信息量大等優點，有利于臨床確診和提供疾病患者的治療方案。

本發明的目的是提供乙肝病毒基因多態性檢測芯片，具體地說，是根據乙肝病毒的基因分型、突變及耐藥性信息設計均一的探針，然后將探針固定在修飾好的玻片上，用熒光標記、全基因擴增法擴增乙肝病毒DNA，然后與芯片雜交，從而得到乙肝病毒的相關信息，從而得到是否有乙肝病毒DNA，乙肝病毒DNA的基因分型，以及臨床有意義的主要突變位點和耐藥性信息等。

本發明的另一目的是提供上述芯片的制作方法及它的樣品處理標記方法。

本發明的第三目的是上述所述芯片的應用。

乙肝病毒多態性檢測芯片實質上是一種高密度的寡聚核苷酸(DNA探針)陣列，設計15-20聚針對相同突變位點、在中央位置有單堿基差異的寡核苷酸，且盡量將針對不同突變位點的寡核苷酸組的Tm值(解鏈溫度)調整到大致相同。

??針對前核心區設計的探針為?????長度?????????Tm

??TGGCTTTGGGGCAT???????????????14???????????50

??TGGCTTTaGGGCATG??????????????15???????????47.48

??TGGCTTTaGGaCATGGA????????????17???????????49.45

??GCTTTGGGaCATGGAC?????????????16???????????48.1

另外，設計丙肝探針作為陰性對照。為了減少雜交的空間位阻，合成時，在寡核苷酸的5’端加一段polyT(連接臂)，連接臂的長度為8-20聚時，雜交效果好，最后為了使寡核苷酸能固定在玻片上，在寡核苷酸的5’端進行氨基修飾。

針對基因型區設計的探針為：??????????長度????????????????Tm

ACCATGCAAGACCTGC????????????????????16?????????????????48.77

CATGCCGGACCTGC??????????????????????14?????????????????50.47

TTCGCAAAATTCCTATG???????????????????17?????????????????47.41